דרישות קדם: פיזיקה תרמית, שיטות בפיזיקה עיונית ב׳

סוג הקורס: שיעור ותרגול

מטרת הקורס: 

הכרת העקרונות הפיזיקליים של החומרים הרכים המהווים את אבני הבניין של מערכות ביולוגיות.

נושאי הקורס:

1) Polymer physics: Freely jointed chain, Freely rotating chain, Worm-like chain, Radius of gyration, Gaussian chain.

2) Polymer interaction: Self-avoidance, Flory theory, Polymer networks mechanics

3) Assembly theory and phase separation – Filaments, oligomers, micelles, microemulsions and membranes, liquid crystal phases, Critical aggregation concentration, Smoluchowski equation.

4) Reaction Kinetics, out of equilibrium system and metabolism: Law of mass action, Competitive and cooperative binding, reaction-diffusion and pattern formation.

5) Introduction to Stochastic Dynamics: Markov process, master equation and Fokker-Planck equation

חובות הקורס והערכת הסטודנטים: 
בחינה מסכמת (100% מהציון הסופי) 
תרגילי בית (הגשה כתנאי לגישה לבחינה)

ביבליוגרפיה:

1) Poon W. C. K & Andelman D.: Soft Condensed Matter Physics in Molecular and Cell Biology; 2006, Taylor & Francis

2) M. Doi, Soft Matter Physics; Oxford University Press; 1st edition (2013)

3) David Boal, Mechanics of the Cell, Cambridge University Press (2012)

4) M. Rubinstein and R.H. Colby, Polymer Physics, 1st Edition; Oxford University Press